Tabel berikut menyajikan sebuah hirarki, dan oleh karena itu agak cacat, melihat tokoh utama dalam gerakan Al-Qaeda. Harus dicatat bahwa Al-Qaeda terbaik digambarkan sebagai jaringan dari jaringan dan bahwa hal itu tidak diatur sebagai sebuah hirarki tradisional. Struktur tingkat dimaksudkan sebagai pedoman untuk membedakan tingkat kewenangan yang dicurigai militan berbeda. Peran khusus yang tercantum untuk setiap militan adalah apa yang dicurigai berdasarkan kecerdasan open source yang tersedia. Selain itu, daftar ini tidak lengkap karena hanya mewakili apa yang dikenal. Ini adalah kepastian dekat bahwa ada banyak tokoh penting lainnya yang terlibat dalam Al-Qaeda dan militan yang telah ditangkap atau dibunuh telah diganti dalam peran mereka dalam organisasi. Beberapa angka-angka milik terutama untuk lain organisasi-organisasi ekstremis Islam, tetapi juga telah menjadi berafiliasi dengan Al-Qaeda.
Tier 1
Usama Bin Ladin
Saudi (Leader) - at large
Ayman Zawahiri
Egyptian (Deputy) - at large
Saif al Adel
(aka Saif Adel Makkawi), Egyptian (Security Chief) - at large
Muhammed Atef
Egyptian (Operations Chief)
- killed
Khalid Sheikh Mohammed
Pakistani/Kuwaiti (Operations Planner) - captured
Tier 2
Abu Faraj al-Libbi
Libyan (Operational planner, some claim he was 3rd in command) - captured
Mafouz Ould Walid
Mauritanian (Counselor) - unknown, presumed killed
Abd Rahim Nashiri
Saudi (Persian Gulf Operational Coordinator) - captured
Abu Musab Zarqawi
(aka Ahmad Fadeel Khalayleh) Jordanian (Operational Planner) - killed
Zayn Abidin Muhammed Hussein
(aka Abu Zubaida) Palestinian (Operational Planner) - captured
Tawfiq Attash
(aka Khallad) (Pakistan Coordinator) - at large
Yazid Sufaat
Malaysian (Biological weapons production) - captured
Fazul Abdullah Mohammed
Comoros (Africa field commander) - at large
Sheik Said Al-Masri
(Financial Aide) - at large
Riduan Isamuddin
(aka Hambali) Indonesian (Southeast Asia Coordinator) - captured
Abu Hamza Rabia
(Senior international operations commander) - reportedly killed
Tier 3
Karim Mejjati
Moroccan (Operation Planner) - killed
Zaid Khayr
(Operational Commander) - at large
Saad bin Laden
Saudi (son of Usama bin Laden) - at large
Abu Ali Harithi
(aka Abu Ali) Yemeni, (USS Cole attack planner) - killed
Abdullah Ahmed Abdullah Egyptian (Intelligence Chief) - at large
Ramzi Binalshibh
Yemeni (9/11 Coordinator in Hamburg) - captured
Abu Zubair Haili
Saudi (Operational Planner, Recruiter) - captured
Midhat Mursi
(aka Abu Khabab), Egyptian (Chemical Weaponeer) - unknown
Ibn Shaykh Libi
(Trainer – Training Camp Commander) - captured
Sulaiman Abu Ghaith
(aka Gaith Abu Yusuf), Kuwaiti (Spokesman) - at large
Ali Abdul Aziz Ali
(aka Ammar al-Baluchi) (Nephew of Khalid Sheik Mohammed) - captured
Mustafa Ahmed Hawsawi
(aka Shaykh Saiid) Saudi (Media committee member) - captured
Abd Hadi al-Iraqi
(Trainer – Camp Commander) - detained
Mohammad Jamal Khalifa
Saudi (Financier, bin Laden's brother-in-law) - at large
Hasan Ghul
Pakistani (Operational Planner) - captured
sumber : http://www.eryevolutions.co.cc/2011/04/menelusuri-markas-al-qaeda-bag4.html